Mặc dù Sông Nile mang lại nhiều lợi ích, nhưng nó cũng phải đối mặt với không ít thách thức, từ biến đổi khí hậu đến xung đột về quyền sử dụng nước. Việc thiếu sự hợp tác hiệu quả giữa các quốc gia ven sông có thể dẫn đến những vấn đề nghiêm trọng trong việc phân chia nguồn tài nguyên này. Những năm gần đây, các cuộc đàm phán về việc chia sẻ nguồn nước sông Nile đã trở nên căng thẳng, đặc biệt là giữa Ai Cập và Ethiopia liên quan đến việc xây dựng